MySQL的每个数据库都对应存放在一个与数据库同名的文件夹中，MySQL数据库文件包括MySQL所建数据库文件和MySQL所用存储引擎创建的数据库文件。
1、MySQL创建并管理的数据库文件：
.frm文件：存储数据表的框架结构，文件名与表名相同，每个表对应一个同名frm文件，与操作系统和存储引擎无关，即不管MySQL运行在何种操作系统上，使用何种存储引擎，都有这个文件。
除了必有的.frm文件，根据MySQL所使用的存储引擎的不同（MySQL常用的两个存储引擎是MyISAM和InnoDB），存储引擎会创建各自不同的数据库文件。
2、MyISAM数据库表文件：
.MYD文件：即MY Data，表数据文件
.MYI文件：即MY Index，索引文件
.log文件：日志文件
3、InnoDB采用表空间（tablespace）来管理数据，存储表数据和索引，InnoDB数据库文件（即InnoDB文件集，ib-file set）：
ibdata1、ibdata2等：系统表空间文件，存储InnoDB系统信息和用户数据库表数据和索引，所有表共用
.ibd文件：单表表空间文件，每个表使用一个表空间文件（file per table），存放用户数据库表数据和索引
日志文件： ib_logfile1、ib_logfile2
二、MySQL数据库存放位置：
1、MySQL如果使用MyISAM存储引擎，数据库文件类型就包括.frm、.MYD、.MYI，默认存放位置是C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\MySQL\MySQL Server 5.1\data
2、MySQL如果使用InnoDB存储引擎，数据库文件类型就包括.frm、ibdata1、.ibd，存放位置有两个，
.frm文件默认存放位置是C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\MySQL\MySQL Server 5.1\data， ibdata1、.ibd文件默认存放位置是MySQL安装目录下的data文件夹
参考资料：
http://www.innodb.com/doc/innodb_plugin-1.0/innodb-file-format.html
http://forge.mysql.com/wiki/MySQL_Internals_File_Formats
http://lampsig.org/new/archives/27-LAMPsig-MySQL-Class-Class-3.html
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4ca059540100d78o.html
来源：网络
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