假设应用场景如下：Teacher与Student是多对多的关系，其中，Teacher类对应teacher表如下：

CREATE TABLE `teacher` (
`id` bigint(20) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`name` varchar(50) DEFAULT NULL,
PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=3 DEFAULT CHARSET=utf8;

Student类对应student表如下：

CREATE TABLE `student` (
`id` bigint(20) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`name` varchar(50) DEFAULT NULL,
PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=3 DEFAULT CHARSET=utf8;

中间表teacher_student表如下：

CREATE TABLE `teacher_student` (
`id` bigint(20) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`teacher_id` bigint(20) NOT NULL ,
`student_id` bigint(20) NOT NULL ,
PRIMARY KEY (`id`),
KEY `fk_reference_50` (`teacher_id`),
CONSTRAINT `fk_reference_50` FOREIGN KEY (`teacher_id`) REFERENCES `teacher` (`id`),
KEY `fk_reference_60` (`teacher_id`),
CONSTRAINT `fk_reference_60` FOREIGN KEY (`student_id`) REFERENCES `student` (`id`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=3 DEFAULT CHARSET=utf8;

Student类如下：

public class Student{
//对应的教师集合
private Set teachers = new HashSet();

/*
* @ManyToMany 注释表示Student是多对多关系的一边，mappedBy 属性定义了Student 为双向关系的维护端
*/
@ManyToMany(mappedBy = “students”)
public Set getTeachers() {
return teachers;
}

public void setTeachers(Set teachers) {
this.teachers = teachers;
}
}

说明

1、该类经过简化，没有列出全部代码，在此我们只关注ManyToMany注解及其属性设置。

其他属性说明参加上篇文章：如何使用JPA注解标注一对一的关系

public class Teacher implements Serializable {
// 对应的学生集合
private Set students = new HashSet();

/*
* @ManyToMany 注释表示Teacher 是多对多关系的一端。
* @JoinTable 描述了多对多关系的数据表关系，name属性指定中间表名称。
* joinColumns 定义中间表与Teacher 表的外键关系，中间表teacher_student的teacher_id 列是 teacher 表的主键列对应的外键列。
* inverseJoinColumns 属性定义了中间表与另外一端(Student)的外键关系。
*/
@ManyToMany(cascade = CascadeType.PERSIST, fetch = FetchType.LAZY)
@JoinTable(name = “teacher_student”,
joinColumns ={@JoinColumn(name = “teacher_id”, referencedColumnName = “id”) },
inverseJoinColumns = { @JoinColumn(name = “student_id”, referencedColumnName = “id”)
})
public Set getStudents() {
return students;
}

public void setStudents(Set students) {
this.students = students;
}
}

说明：

1、@JoinTable
@JoinTable注解定义了联接表的表名，连接列数组，以及invers连接列数组。invers连接列数组是关联表中关联到student表主键的列(the “other side”)。

被关联端（Student）不必也不能描述物理映射：只需要一个简单的mappedBy参数，该参数包含了主体端（Teacher）的属性名，这样就绑定了双方的关系。

默认值：

和其它许多注解一样，在多对多关联中很多值是自动生成，当双向多对多关联中没有定义任何物理映射时，Hibernate根据以下规则生成相应的值：

关联表名：主表表名+下划线+从表表名；
关联到主表的外键名：主表名+下划线+主表中的主键列名；
关联到从表的外键名：主表中用于关联的属性名+下划线+从表的主键列名。

以上规则对于双向一对多关联同样一样。

代码及注释来自：http://lym6520.iteye.com/blog/314065