先总的说一下区别：
File.pathSeparator指的是分隔连续多个路径字符串的分隔符，例如:
java -cp test.jar;abc.jar HelloWorld
就是指“;”
File.separator才是用来分隔同一个路径字符串中的目录的，例如：
C:\Program Files\Common Files
就是指“\”
separatorChar
public static final char separatorChar
与系统有关的默认名称分隔符。此字段被初始化为包含系统属性 file.separator 值的第一个字符。在 UNIX 系统上，此字段的值为 ‘/’；在 Microsoft Windows 系统上，它为 ‘\’。
separator
public static final String separator
与系统有关的默认名称分隔符，为了方便，它被表示为一个字符串。此字符串只包含一个字符，即 separatorChar。
pathSeparatorChar
public static final char pathSeparatorChar
与系统有关的路径分隔符。此字段被初始为包含系统属性 path.separator 值的第一个字符。此字符用于分隔以路径列表形式给定的文件序列中的文件名。在 UNIX 系统上，此字段为 ‘:’；在 Microsoft Windows 系统上，它为 ‘;’。
pathSeparator
public static final String pathSeparator
与系统有关的路径分隔符，为了方便，它被表示为一个字符串。此字符串只包含一个字符，即 pathSeparatorChar。
[整理自网络]
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